Empedrado nació oficialmente el 14 de septiembre de 1826, cuando Pedro Ferré fundó el pueblo, aunque la ley de fundación se había aprobado un año antes, el 14 de septiembre de 1825. Su ubicación en el noroeste de Corrientes, sobre la margen oriental del río Paraná, permitió habilitar un puerto para comercio en 1852 y consolidar la Municipalidad en 1864.
Los primeros asentamientos surgieron en Fortín Santiago Sánchez y Pueblo Viejo a mediados del siglo XVII, pero fueron destruidos por invasiones indígenas en el siglo XVIII. En 1806 se formó el primer núcleo alrededor de la Capilla del Señor. La figura patrona, El Señor Hallado, es una talla de madera elaborada por manos nativas que aún se conserva.
La educación llegó en 1827 con las primeras escuelas. Entre sus edificios históricos, la Mansión de Invierno se inauguró el 29 de junio de 1913 como hotel, casino y sala de fiestas, sobre 12.000 metros cuadrados. La ciudad conserva atractivos naturales e históricos como Ocantos Cue, Arroyo Sombrero, Laguna Sati y Laguna Tabaco, y es conocida como «La Perla del Paraná».
El nombre Empedrado remite a las antiguas canteras de granito de la zona, un vínculo directo con sus orígenes.
